ندى المرغلاني | Nada Almarghalani
ندى المرغلاني | Nada Almarghalani

@na_marghalani

2 تغريدة 168 قراءة Jul 12, 2022
علم المعلوماتية الحيوية (Bioinformatics) من أكثر التخصصات المبهرة اللي لها مستقبل واعد باذن الله خصوصًا مع رؤية 2030 والاهتمام المتزايد بمشروع الجينوم السعودي 💻🧬✨
لو كنت مهتم بالـBioinformatics تابع معايا التغريدات الجاية ولا تنسوا ♥️ & 🔁
📌ما هو علم المعلوماتية الحيوية‼️
هو العلم الذي يدمج بين علم الأحياء والإحصاءات وعلم الكمبيوتر والحاسوب
فمصطلح Bioinformatics مكون من جزئين:
🔸Bio: اختصار علوم الأحياء والمجالات البيولوجية والوراثية
🔸Informatics: اختصار information وهي المتعلقة بتحليل البيانات الجينية والحيوية
📌 أهمية المعلوماتية الحيوية:
مثلًا عند وجود طفرة معينة يتم جمع العينات وتحليلها للبحث عن مكان الطفرة ونتيجة عدد العينات الكبير نحتاج إلى ترتيب وتجميع قاعدة البيانات لتسهيل دراستها وهنا تظهر أهمية المعلوماتية الحيوية لتحديد مكان الطفرة في الجين المحدد وتعطينا تنبؤ لمسببات المرض.
📌 علاقة المعلوماتية الحيوية والعلوم الأخرى:
هناك علاقة كبيرة بين المعلوماتية الحيوية والعديد من العلوم مثل:
🔸 علم الجينومات (Genomic)
🔸 علم البروتينات (Proteomics)
🔸 علم الأحياء الحاسوبي (Computational Biology)
والعديد من العلوم الأخرى.
📌 أساسيات المعلوماتية الحيوية:
🔸 قواعد البيانات (Databases): قواعد البيانات التي تحتوي على تسلسل الجينوم البشري، وتسلسل الجينات والبروتينات للعديد من الكائنات الحية التي تم دراستها وتحليلها، ومن خلالها نقوم بتحليل البيانات البيولوجية لجين أو بروتين معين.
🔻
🔸 Alignment: خطوة مهمة لعمل genetic mapping، فنقارن بين two sequences ونحدد أوجه التشابه بينهم وفي أي منطقة بالتحديد.
مثال: لو قدرنا نحدد sequence غير معروف، عن طريق ال alignment حنحدد أقرب sequence مشابه له ويسهل علينا معرفة الوظيفة أو التركيب.
🔻
🔸 Multiple sequence alignment: تحديد مناطق الشبه والاختلاف بين أكثر من sequence، فلو مثلًا عندنا مجموعة بروتينات بواسطة MSA نقدر نحدد مناطق التشابه او الـDomains المشتركة بينهم وتحديد عائلة البروتين اللي تنتمي له.
🔻
🔸 Phylogenetic tree: المقصود بها شجرة القرابة أو العلاقة بين الكائنات الحية، فتحدد علاقة الكائنات أو الجينات أو البروتينات ببعضها.
📌 قواعد بيانات المعلوماتية الحيوية:
🔸 NCBI: أكبر قاعدة بيانات تضم العديد من التسلسلات الجينية والبروتينية والنيوكلوتيدات للعديد من الكائنات الحية.
ncbi.nlm.nih.gov
🔸 GenBank: قاعدة بيانات الجينات الامريكي التابعة لـNCBI.
📌 أهم أدوات المعلوماتية الحيوية:
🔸 برنامج BLAST: برنامج يقارن بين تسلسل القواعد النيتروجينية والبروتينات ومقارنتها مع البيانات المخزنة في قواعد البيانات، لمعرفة نسبة الشبه وتحديد الوظيفة أو العائلة التي ينتمي لها البروتين أو الجين.
blast.ncbi.nlm.nih.gov
🔸 STRING: أداة تسهل التعرف على وظيفة البروتين من خلال تكوين شبكة معلومات للتفاعل بين البروتينات.
string-db.org
🔸 RCSB PDB: قاعدة بيانات للشكل الثلاثي الأبعاد للبروتينات المكتشفة.
rcsb.org
🔸 Uniprot: قاعدة بيانات للبروتينات، تحتوي على جميع بيانات تسلسل البروتينات التي تم اكتشافها وتحليلها.
uniprot.org
🔸 phylogey.fr: برنامج يستخدم لبناء شجرة العلاقة والارتباط بين البيانات المدخلة، لتوضح العلاقة والارتباط بينهما.
phylogeny.fr
🔸 PyMOL: برنامج يستخدم للتنبؤ بالتركيب الثلاثي الأبعاد للبروتين.
pymol.org
🔸 GENE MANIA: أداة لتحديد وظائف جين معين وعلاقته بالجينات الأخرى.
genemania.org
ولو حابين تفهموا أكثر عن المعلوماتية الحيوية أستاذة سمر اتكلمت قبل عن توفر ورش مجانية اون لاين من موقع NCBI 🔻✨
📌 وهذا مرجع ممتاز وبسيط لأساسيات علم الجينوم والمعلوماتية الحيوية 🔻✨
4s99y7bnsn.download2.org

جاري تحميل الاقتراحات...