من الخدمات التي يقدمها موقع NCBI هو معرفة من أين أتى الكائن الدقيق (فايروس بكتيريا..الخ)بمعنى انك تضع تسلسل جيني (Sequence) لحامض نووي لفايروس مثلا ويظهر لك تسلسلات جينية لاحماض نووية لفيروسات تتشابه مع الفايروس المراد معرفة اصله او طريقة تكوينه، السؤال الان:
كيف تتم هذه الطريقة؟
سيكون المثال على فايروسSARS-CoV2، بداية ندخل على الرابط الاتي:
ncbi.nlm.nih.gov
ثم نكتب الكائن الدقيق المراد معرفة اصله في مستطيل البحث، كما في الصورة ومثالنا فايروسSARS-CoV2 نكتب Covid19 ظهرت معي الصفحة(كما في الصورة) نضغط
على اللي عليه دائره.
سيكون المثال على فايروسSARS-CoV2، بداية ندخل على الرابط الاتي:
ncbi.nlm.nih.gov
ثم نكتب الكائن الدقيق المراد معرفة اصله في مستطيل البحث، كما في الصورة ومثالنا فايروسSARS-CoV2 نكتب Covid19 ظهرت معي الصفحة(كما في الصورة) نضغط
على اللي عليه دائره.
بعدها سينقلنا الى صفحة اخرى التي فيها التسلسل الجيني
وعلى اليمين موجود Run Blast نضغط عليها بينقلني الان الى صفحة فيها مستطيل وفيها التسلسل الجيني اللي ابي اعرف من وين تم تكوينه، التسلسل موجود على شكل Accession Number هو: 045512.2_NC فمن الممكن اني اضع التسلسل الجيني
وعلى اليمين موجود Run Blast نضغط عليها بينقلني الان الى صفحة فيها مستطيل وفيها التسلسل الجيني اللي ابي اعرف من وين تم تكوينه، التسلسل موجود على شكل Accession Number هو: 045512.2_NC فمن الممكن اني اضع التسلسل الجيني
او اضع:
Accession Number
الان تحت بشوف مكتوب exclude اضع عليها اشارة صح واكتب في المتسطيل كالتالي:
SARS-CoV-2(taxid: 2697049)
ايضا ً اضغط على علامة + يمين وييظهر لي مستطيل اخر واكتب فيه:
synthetic construct(taxid: 32630)
ولاننسى علامة صح، المفترض تكون معك الصورة النهائية
Accession Number
الان تحت بشوف مكتوب exclude اضع عليها اشارة صح واكتب في المتسطيل كالتالي:
SARS-CoV-2(taxid: 2697049)
ايضا ً اضغط على علامة + يمين وييظهر لي مستطيل اخر واكتب فيه:
synthetic construct(taxid: 32630)
ولاننسى علامة صح، المفترض تكون معك الصورة النهائية
اللي عملته اني استبعدت اي تشابه لتسلسل الجيني لنفس الفايروس في نفس الكائن، يعني كل تسلسل جيني لفايروس كورونا يصيب الانسان بيستبعده، لكن اللي يصيب الخفاش مثلا بيضعه لي وهكذا، الان هذه النتيجة النهائية تظهر لي
فايروس كورونا اللي يصيب الخفاش نسبة التشابه ٩٦ ٪
وفايروس كورونا اللي يصيب حيوان Pangolin (قط الزباد) نسبة التشابه ٩٠٪ ، واذا نزلت تحت بشوف نسبة التشابه مع فايروس
SARS-Cov1 اللي ظهر ٢٠٠٣ نسبة تشابه تسلسل الحامض النووي تصل الى ٨٢٪
وشكراً
وفايروس كورونا اللي يصيب حيوان Pangolin (قط الزباد) نسبة التشابه ٩٠٪ ، واذا نزلت تحت بشوف نسبة التشابه مع فايروس
SARS-Cov1 اللي ظهر ٢٠٠٣ نسبة تشابه تسلسل الحامض النووي تصل الى ٨٢٪
وشكراً
جاري تحميل الاقتراحات...